O terceiro filme, Men in Black, é uma continuação da famosa comédia americana. O elenco é o mesmo Tommy Lee Jones e Will Smith. O trabalho do diretor foi retomado por Barry Sonnenfeld, produtor executivo de Steven Spielberg. Nos cinemas, o filme começou em 23 de maio de 2012.
Desta vez, o papel do herói negativo é assumido por Jamain Clement, ele interpreta Boris. Este é um criminoso que escapou da prisão lunar. Ele queima com ódio o agente Kay, que em julho de 1969 pegou o criminoso e o deixou sem uma mão. Quando Kay de repente descobre que Boris estava fugindo, ele lamenta muito por não o ter matado durante a prisão. Depois disso, o agente simplesmente desaparece, e isso apenas Jane lembra que ele existia. O resto da equipe de preto acha que Kay morreu em um confronto com algum criminoso em 1969.
A única explicação para essa convulsão da realidade é uma mudança no passado. Jay e o agente O decidem que Boris estava envolvido. A confirmação disso é outro evento de escala cósmica - a invasão da raça de Boris na Terra. Na realidade anterior, isso era impossível, pois Kay instalou um dispositivo de proteção no planeta chamado "ArcNet". Agora, em conexão com a morte do agente algumas décadas atrás, a Terra não teve nenhuma triagem dos inimigos espaciais.
Jay descobre que Boris foi enviado ao passado por Jeffrey Price, um revendedor de eletrônicos que teve um desvio ilegal de tempo em seu arsenal. O agente não tem escolha a não ser voltar no tempo para salvar seu parceiro. E ele é imediatamente preso pelo jovem Kay. Durante o interrogatório, Jay conta tudo e o futuro parceiro acredita. Juntos, eles encontram o Arcanian Griffin, que tem ArkNet. Agora, os três continuam sua jornada e partem para estabelecer proteção na lua. Mas em um foguete eles são presos pelo coronel. Agora ele se torna o guardião do mistério de Jay.
A partir deste momento, ocorre um rápido desenvolvimento de eventos. Os heróis se encontram com dois Boris e uma luta ocorre. Um criminoso do futuro é jogado em uma mina de foguetes, e o jovem Boris também vai atrás dele. Proteção de terra instalada. E parece que a missão de Jay foi concluída, mas milagrosamente um jovem criminoso que sobreviveu aparece. O coronel morre, mas Boris consegue ser destruído. E no filme um novo personagem aparece. Um garoto sai do carro do coronel e começa a procurar seu pai. O agente se reconhece. Jay retorna no devido tempo e encontra Kay no café. Tudo voltou.